Истоки создания Военного трибунала Якутского гарнизона начинаются с далёкого 1953 г., когда на основе упразднённого военного трибунала войск МВД Якутской АССР был образован военный трибунал гарнизона города Якутска, который 9 ноября 1953 г. на основе устного распоряжения председателя Военного трибунала Забайкальского Военного округа гвардии полковника юстиции Астахова, возглавил в качестве временно исполняющего обязанности председателя военного трибунала майор юстиции Шаманаев Пётр Иванович. С этой даты принято считать день образования Якутского гарнизонного военного суда.

         Между прочим, о данной дате стало известно совсем недавно из архива Восточно-Сибирского окружного военного суда, поскольку до 1 декабря 1998 г. Военный трибунал Якутского гарнизона входил в состав Забайкальского военного округа, а отчёт даты образования Якутского гарнизонного военного суда вёлся с 10 июля 1984 г., по имеющемуся в гарнизонном военном суде судебному постановлению.

         Как следует из исторических документов уже в ноябре 1953 г. Военный трибунал гарнизона города Якутска переименован в Военный трибунал Якутского гарнизона, который 9 ноября 1954 г. возглавил его первый председатель  майор юстиции Бушев, при этом сам трибунал был трёхсоставным, помимо председателя в него входили  члены трибунала майоры юстиции Шаманаев и Руденко.

         Из книг приказов Военного трибунала Якутского гарнизона 1954-1960 гг. видно, что уже в то время члены военного трибунала, систематически выезжали в северный пос. Тикси для проведения судебных заседаний. Следует отметить, что участие в выездных судебных заседаниях Военного трибунала Якутского гарнизона не ограничивалось только пос. Тикси, как видно из приведённых книг состав суд Военного трибунала Якутского гарнизона в разное время выезжал в служебные командировки для рассмотрения уголовных дел в посёлки Айхал, Эге-Хая, Аллайха,  Чокурдах, Батагай, Чульман, Сангары, нижние-Кресты, Усть-Нера, Покровск, Мухтуя, г. Алдан и др.

При этом помимо командировок  для проведения судебных заседаний, члены и работники аппарата военного трибунала систематически выезжали в служебные командировки в г. Читу для прохождения различного рода стажировок. Всё это свидетельствует, что военный трибунал Якутского гарнизона постоянно стоял на страже закона.

Несмотря на это, вопреки особенностей судопроизводства в столь сложном по климатическим и транспортным условиям региону - Якутской АССР, в связи с проводимой руководством советского государства реформой Вооружённых сил СССР  в соответствии с законом Верховного Совета СССР  от 15 января 1960 г. «О новом значительном сокращении Вооружённых Сил СССР» и во исполнение директивы Главного штаба Сухопутных войск от 4 июля 1960 г.  № ОШ/4/290646 Военный трибунал Якутского гарнизона с 11октября 1960 г. был расформирован, а его председатель полковник юстиции Фоменко убыл к новому месту военной службы в город Ташкент. В то же время на территории Якутской АССР в пос. Тикси был образован Военный трибунал Тиксинского гарнизона, который действовал до 2004 г.

Однако, Якутск не долго оставался без присутствия военного трибунала, поскольку уже 10 июля  1984 г. вновь образованный военный трибунал под председательством полковника юстиции Решетника В.И. вынес своё первое, после более чем 20-летнего перерыва, постановление.

Таким образом, на территории Якутска было возобновлено военно-судебное присутствие в лице Военного трибунала Якутского гарнизона.

В разное время размещение Военного трибунала Якутского гарнизона в Якутске  было  с 1984 г. по 1994 г. в 2-х этажном здании по улице Октябрьская, дом 3, с 1994 г. по 2007 в здании по улице Октябрьская, дом 27, а с 2007 г.  по настоящее время на 6 этаже здания по улице Октябрьская, дом 8 (Военный комиссариат Республики Саха (Якутия)).

Как следует из документов Военного трибунала  Якутского гарнизона в период с 1984 г. по 2000 г. Военный трибунал Якутского гарнизона осуществлял правосудие на всей территории Якутской АССР более чем в 25 воинских частях и учреждениях дислоцированных на её территории, включая пос. Тикси, при этом 15 из них дислоцировались на территории города Якутска и его ближайших районах (пос. Марха, пос. Жатай, г. Покровск, с. Владимировка и т.д.).

Основную категорию дел,  которые рассматривал военный трибунал, составляли уголовные дела, связанные с превышением воинскими должностными лицами власти, хищения военного имущества, преступления, связанные с уклонением от прохождения военной службы, дезертирство, нарушение правил уставных взаимоотношений и др.

В 1999 г. в связи с приводимой в Российской Федерации судебной реформой, в соответствии с Федеральным конституционным законом «О военных судах Российской Федерации»  и приказом Верховного Суда Российской Федерации от 9 декабря 1999 г. № 435КД военные суды гарнизонов, соединений, объединений, флотилий, военных округов и флотов с момента вступления в силу данного закона приобрели  статус гарнизонных и окружных (флотских) военных судов, как следствие военный суд Якутского гарнизона в целях упорядочения деятельности военных судов  был переименован в Якутский гарнизонный военный суд, кроме того он стал относиться к территориальной подведомственности Дальневосточного окружного военного суда, дислоцированного в г. Хабаровске.

В связи с оптимизацией военных судов и подписания Федерального закона от 29 июня 2004 г. № 59-ФЗ «О создании и упразднении некоторых гарнизонных военных судов» в 2004 г. был упразднён Тиксинский гарнизонный военный суд, при этом вопросы осуществления правосудия, относящиеся к его ведению, были переданы в юрисдикцию Якутского гарнизонного военного суда.

Таким образом, сегодня Якутский гарнизонный военный суд является в Республике Саха (Якутия) единственным военным судом военно-судебной системы, юрисдикция которого распространяется на всю территорию Республики Саха (Якутия).

Они  возглавляли военный трибунал – гарнизонный военный суд